De scholier Tetsuko “Alice” Arisugawa wordt overgeplaatst naar de Ishinomori Junior High School. Ze vangt een gerucht op over een moord die een jaar geleden gepleegd werd door vier mensen. Ze ontdekt tevens dat haar klasgenoten het huis naast het hare vrezen en ook wel Hanayashiki, de bloementuin, noemen. Alice besluit het huis te inspecteren en ontmoet daar Hana Arai, een meisje dat sinds kort niet meer naar school gaat.